На информационном ресурсе применяются рекомендательные технологии (информационные технологии предоставления информации на основе сбора, систематизации и анализа сведений, относящихся к предпочтениям пользователей сети "Интернет", находящихся на территории Российской Федерации)

tvr

7 подписчиков

Свежие комментарии

  • Александр Юткин
    Россия и так восстанавливает разоренную Украину за свой счет. Брито-пиндосня только оружие да наемников поставляет дл...Страны G7 намерен...
  • Надежда Белугина
    Всё время старается нашего президента держать на крючке: если ты не так, то...То обнимет, то нагадит. Надеждин не к н...Украина заслужива...
  • Гарий Щерба
    КАК ТАК НЕ ЛЕЗТЬ ?? ,  ЛЯГУШАТНИКИ  в  ЧУЖОМ ГЛАЗУ СОРИНКУ ЗАМЕЧАЮТ  а в своём  БРЕВНА СУКИ НЕ ВИДЯТ ....!!!Разлад в цветущем...

В России создали систему, которая позволит выводить новые полезные штаммы микробов

Ученые Института цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук (ИЦиГ СО РАН) разработали программный комплекс для анализа геномов микроорганизмов. По их словам, разработка поможет упорядочить данные о генетическом материале бактерий, что будет способствовать дальнейшим исследованиям и выведению новых полезных штаммов микробов. Результаты опубликованы в сборнике конференции Parallel Computing Technologies, сообщает РИА Новости.

Специалисты отметили, что сегодня в хранилище геномов микроорганизмов, с которым работают ученые ИЦиГ, находится информация о порядка 1,5 тыс. штаммов, причем эти данные разнородные, начиная от простых коротких прочтений и собранных геномов и заканчивая полногеномными аннотациями и математическими моделями.

Понятие "полногеномная аннотация" подразумевает получение полной последовательности генетически наследуемой информации генома. Далее с помощью аналитических программ определяется то, какие функциональные гены там находятся. Ученые могут использовать созданное программное обеспечение для сравнения различных штаммов и прогнозирования новых свойств микробов.

Исследователи ведут также поиск оптимальных метаболических путей для эффективного производства полезных веществ (например, аминокислот) с помощью изменения генетического набора либо среды обитания микроорганизмов.

Алексей Мухин, младший научный сотрудник сектора биоинформатики и информационных технологий в генетике ИЦиГ СО РАН, выпускник аспирантуры ИЦиГ:

Использование бактерий в производстве веществ для фармакологии, кормовых добавок, бытовой химии - это уже чисто прикладная задача, которая подразумевает работу по соглашениям с промышленными партнерами.

Он добавил, что сейчас проект используют в рамках одного исследовательского центра, в перспективе он будет доступен и другим ученым, работающим с геномами бактерий. Биологи ИЦиГ СО РАН с помощью разработанного программного комплекса проводят аналитические вычисления на уже собранных и аннотированных геномах без применения экспериментальных методов.

"Предложенная система решает задачи института в представлении генетической информации наших штаммов в совокупности с математическими моделями метаболизма", - подчеркнул Мухин.

В данном проекте работают биологи, математики и программисты.

В ИЦиГ СО РАН отметили важность того, что в проекте задействованы молодые ученые. "IT-специалист Алексей Мухин пришел в научную аспирантуру ИЦиГ и со временем занял одну из ключевых ролей в нашем коллективе, ведущем разработки в области математического моделирования микроорганизмов. Его вклад стал именно тем "кирпичиком", которого им не хватало, поскольку в коллективе преобладают генетики и биологи. Так научная аспирантура дает старт карьере молодого ученого, а институту позволяет привлекать необходимые молодые таланты в работу своих исследовательских групп", - рассказал ведущий научный сотрудник ИЦиГ СО РАН Сергей Лашин.

По словам специалистов ИЦиГ СО РАН, важность создания собственного программного обеспечения подчеркивали, в частности, на круглом столе, организованном Курчатовским геномным центром на X Международном форуме технологического развития "Технопром-2023".

Фото: pexels.com


Вам также может понравится:

Ученые Института цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук (ИЦиГ СО РАН) разработали программный комплекс для анализа геномов микроорганизмов. По их словам, разработка поможет упорядочить данные о генетическом материале бактерий, что будет способствовать дальнейшим исследованиям и выведению новых полезных штаммов микробов. Результаты опубликованы в сборнике конференции Parallel Computing Technologies, сообщает РИА Новости.

Специалисты отметили, что сегодня в хранилище геномов микроорганизмов, с которым работают ученые ИЦиГ, находится информация о порядка 1,5 тыс. штаммов, причем эти данные разнородные, начиная от простых коротких прочтений и собранных геномов и заканчивая полногеномными аннотациями и математическими моделями.

Понятие "полногеномная аннотация" подразумевает получение полной последовательности генетически наследуемой информации генома. Далее с помощью аналитических программ определяется то, какие функциональные гены там находятся. Ученые могут использовать созданное программное обеспечение для сравнения различных штаммов и прогнозирования новых свойств микробов.

Исследователи ведут также поиск оптимальных метаболических путей для эффективного производства полезных веществ (например, аминокислот) с помощью изменения генетического набора либо среды обитания микроорганизмов.

Алексей Мухин, младший научный сотрудник сектора биоинформатики и информационных технологий в генетике ИЦиГ СО РАН, выпускник аспирантуры ИЦиГ:

Использование бактерий в производстве веществ для фармакологии, кормовых добавок, бытовой химии - это уже чисто прикладная задача, которая подразумевает работу по соглашениям с промышленными партнерами.

Он добавил, что сейчас проект используют в рамках одного исследовательского центра, в перспективе он будет доступен и другим ученым, работающим с геномами бактерий. Биологи ИЦиГ СО РАН с помощью разработанного программного комплекса проводят аналитические вычисления на уже собранных и аннотированных геномах без применения экспериментальных методов.

"Предложенная система решает задачи института в представлении генетической информации наших штаммов в совокупности с математическими моделями метаболизма", - подчеркнул Мухин.

В данном проекте работают биологи, математики и программисты.

В ИЦиГ СО РАН отметили важность того, что в проекте задействованы молодые ученые. "IT-специалист Алексей Мухин пришел в научную аспирантуру ИЦиГ и со временем занял одну из ключевых ролей в нашем коллективе, ведущем разработки в области математического моделирования микроорганизмов. Его вклад стал именно тем "кирпичиком", которого им не хватало, поскольку в коллективе преобладают генетики и биологи. Так научная аспирантура дает старт карьере молодого ученого, а институту позволяет привлекать необходимые молодые таланты в работу своих исследовательских групп", - рассказал ведущий научный сотрудник ИЦиГ СО РАН Сергей Лашин.

По словам специалистов ИЦиГ СО РАН, важность создания собственного программного обеспечения подчеркивали, в частности, на круглом столе, организованном Курчатовским геномным центром на X Международном форуме технологического развития "Технопром-2023".

Фото: pexels.com


Вам также может понравится:

 

Ссылка на первоисточник

Картина дня

наверх